MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp38

Total Repeats: 1110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017421	TAA	2	6	1	6	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017421	ATT	3	9	42	50	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017421	AGTGG	2	10	86	95	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017421	AAT	2	6	126	131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017421	TAC	2	6	165	170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017421	TC	3	6	217	222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017421	CAA	2	6	283	288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017421	A	6	6	308	313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017421	AAAAAT	2	12	336	347	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017421	TTA	2	6	352	357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017421	TAAT	2	8	364	371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017421	ATT	2	6	376	381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017421	TAT	2	6	391	396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017421	ATTAT	2	10	400	409	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017421	AAT	2	6	505	510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017421	AGAA	2	8	531	538	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017421	TAA	2	6	543	548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017421	A	6	6	555	560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017421	TGA	2	6	570	575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017421	A	6	6	579	584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017421	A	7	7	610	616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017421	A	8	8	621	628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017421	AGA	3	9	631	639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017421	CAT	2	6	690	695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017421	ATA	2	6	711	716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017421	CAAAAA	2	12	813	824	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017421	CCT	2	6	827	832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017421	TTA	2	6	885	890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017421	A	6	6	897	902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017421	A	6	6	935	940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017421	ATT	2	6	962	967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017421	TTA	2	6	1008	1013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017421	TA	3	6	1026	1031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017421	A	8	8	1097	1104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017421	ACA	2	6	1113	1118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017421	ACT	2	6	1226	1231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017421	TAG	2	6	1258	1263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017421	TAA	2	6	1277	1282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017421	AGCAA	2	10	1309	1318	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017421	ATA	2	6	1324	1329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017421	TAA	2	6	1364	1369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017421	ATA	2	6	1377	1382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017421	TAT	2	6	1400	1405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017421	TAA	3	9	1414	1422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017421	A	6	6	1427	1432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017421	ATT	3	9	1440	1448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017421	ATA	2	6	1487	1492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017421	TAT	2	6	1561	1566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017421	T	8	8	1611	1618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017421	GCA	2	6	1638	1643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017421	TAGGAA	2	12	1757	1768	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017421	ATT	3	9	1805	1813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017421	A	7	7	1849	1855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017421	A	7	7	1927	1933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017421	TTA	2	6	1935	1940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017421	CTT	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017421	A	6	6	2008	2013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017421	AT	3	6	2103	2108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017421	A	6	6	2152	2157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017421	GTT	2	6	2222	2227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017421	A	6	6	2249	2254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017421	TTTTCA	2	12	2258	2269	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017421	AAAAC	2	10	2281	2290	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017421	T	7	7	2307	2313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017421	ATG	2	6	2374	2379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017421	AAAAT	2	10	2403	2412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017421	A	6	6	2452	2457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017421	A	6	6	2461	2466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017421	T	7	7	2535	2541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017421	TAAAAA	2	12	2567	2578	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017421	TTC	2	6	2631	2636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017421	TGT	2	6	2640	2645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017421	TAT	2	6	2672	2677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017421	ACT	2	6	2743	2748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017421	CTG	2	6	2800	2805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017421	ATT	2	6	2907	2912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017421	TAA	2	6	2995	3000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017421	TCTTT	2	10	3019	3028	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017421	T	7	7	3111	3117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017421	T	6	6	3122	3127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017421	T	6	6	3141	3146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017421	ACT	2	6	3182	3187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017421	T	6	6	3230	3235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017421	ATA	2	6	3293	3298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017421	ATC	2	6	3302	3307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017421	T	6	6	3314	3319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017421	CTA	2	6	3320	3325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017421	TAA	2	6	3335	3340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017421	TA	3	6	3403	3408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017421	T	7	7	3431	3437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017421	ATT	2	6	3439	3444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017421	TAT	2	6	3459	3464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017421	T	6	6	3507	3512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017421	A	6	6	3522	3527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017421	TTA	2	6	3528	3533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017421	CTTT	2	8	3583	3590	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017421	TTAT	2	8	3605	3612	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017421	TAA	2	6	3628	3633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017421	ATA	2	6	3651	3656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017421	TCTT	2	8	3658	3665	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017421	T	7	7	3723	3729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017421	AT	3	6	3743	3748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017421	TTA	2	6	3765	3770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017421	ATT	2	6	3777	3782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017421	AGA	2	6	3824	3829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017421	TAA	2	6	3837	3842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017421	AATT	2	8	3858	3865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017421	ATA	2	6	3937	3942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017421	TAATA	2	10	3945	3954	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017421	TTA	2	6	4012	4017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017421	TTAT	2	8	4085	4092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017421	A	6	6	4096	4101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017421	TAT	2	6	4102	4107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017421	AGAGG	2	10	4173	4182	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017421	ATC	2	6	4198	4203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017421	A	6	6	4204	4209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017421	AAAATA	2	12	4217	4228	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017421	TATT	2	8	4233	4240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017421	GAA	2	6	4282	4287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017421	AAC	2	6	4308	4313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017421	TTTC	2	8	4321	4328	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017421	TAG	2	6	4339	4344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017421	TAA	2	6	4376	4381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017421	A	6	6	4384	4389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017421	TATAAA	2	12	4391	4402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017421	TTTA	2	8	4405	4412	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017421	CAAA	2	8	4428	4435	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017421	AT	3	6	4439	4444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017421	TCT	2	6	4447	4452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017421	ATT	4	12	4461	4472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017421	AT	4	8	4477	4484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017421	A	7	7	4519	4525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017421	TA	3	6	4534	4539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017421	TAA	2	6	4591	4596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017421	A	7	7	4602	4608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017421	GTA	2	6	4635	4640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017421	TAA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017421	AAG	2	6	4680	4685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017421	A	7	7	4686	4692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017421	CTG	2	6	4770	4775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017421	TCC	2	6	4797	4802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_017421	TAA	2	6	4837	4842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017421	ACCA	2	8	4852	4859	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017421	A	8	8	4878	4885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017421	A	7	7	4891	4897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017421	CTA	2	6	4914	4919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017421	GAA	2	6	4922	4927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017421	TTA	2	6	4965	4970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017421	TAA	2	6	5031	5036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017421	AAT	2	6	5039	5044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017421	ATG	2	6	5049	5054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017421	A	7	7	5075	5081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017421	CAT	2	6	5082	5087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_017421	TAA	2	6	5088	5093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017421	A	6	6	5092	5097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_017421	A	6	6	15645	15650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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